勞動合同可以扣除休息日工資嗎

不可以。依據我國相關法律規定，勞動者是有休息時間的，在法定的休息時間內，是計算勞動報酬的，用人單位不得扣除休息日的工資。
《中華人民共和國勞動法》
第三十六條國家實行勞動者每日工作時間不超過八小時、平均每週工作時間不超過四十四小時的工時制度。
第三十八條用人單位應當保證勞動者每週至少休息一日。
第五十一條勞動者在法定休假日和婚喪假期間以及依法參加社會活動期間，用人單位應當依法支付工資。