原告主体不适格如何处理

根据法律规定，起诉立案的标准之一是原告与本案具有利害关系，也就是原告主体适格。立案时发现原告主体不适格的，人民法院不予受理;立案受理后发现原告主体不适格的，告知原告后，原告可以撤回起诉。

若原告拒不撤回起诉的，人民法院依法作出民事裁定书，裁定驳回原告的起诉。

法律依据：《税务行政应诉工作规程》 第十五条

 经审查发现下列情形之一的，应当在答辩状中写明，提请人民法院裁定驳回原告的起诉：
(一)原告无诉讼主体资格;
(二)没有明确的被告或者错列被告;
(三)没有具体的诉讼请求或者事实根据;
(四)不属于人民法院受案范围或者受诉人民法院管辖;
(五)超过法定起诉期限且无正当理由;
(六)未按照法律规定由法定代理人、指定代理人、代表人为诉讼行为;
(七)未按照法律、法规规定先向行政机关申请复议;
(八)重复起诉;
(九)撤回起诉后无正当理由再行起诉;
(十)行政行为对其合法权益明显不产生实际影响;
(十一)诉讼标的已为生效裁判所羁束;
(十二)不符合其他法定起诉条件。