分公司能否作为行政处罚主体

不可以。
分公司是公司在其住所以外设立的从事经营活动的机构。分公司是不可以作为行政处罚对象的，处罚的应该是总公司，因为分公司不具有法人资格，其民事责任由公司承担。
《公司法》第十四条