能否按照竣工結算檔案結算工程價款

可以。《最高人民法院關於審理建設工程施工合同糾紛案件適用法律問題的解釋》第二十條

當事人約定，發包人收到竣工結算檔案後，在約定期限內不予答覆，視為認可竣工結算檔案的，按照約定處理。承包人請求按照竣工結算檔案結算工程價款的，應予支援。