协议书复印件有效吗

有效，只要是双方真实意思表示且不违反法律规定。但是如果从法律风险上说，仍建议保留书面原件，以防发生纠纷的时候无法证明双方当时的合意，保障当事人的权益。
从证据角度来说，复印从技术上可以被篡改，因此单单复印件的证明效力是很低的，除非对方对扫描件认可，否则需要提供其它相关证据进行佐证，形成证据链条，复印件才能作为定案证据，从而具有较高证明效力，仅凭复印件去打官司是很难得到法院支持。
《民法典》第四百六十九条 当事人订立合同，可以采用书面形式、口头形式或者其他形式。
书面形式是合同书、信件、电报、电传、传真等可以有形地表现所载内容的形式。
以电子数据交换、电子邮件等方式能够有形地表现所载内容，并可以随时调取查用的数据电文，视为书面形式。