分公司入股协议有效吗

看情况来判定：
其一、如果该协议是当事人真实的意思表示，并且内容不违反法律法规和社会公序良俗的，则该协议有效；
其二、如果不符合上述情况的，则该协议无效。
《民法典》第一百四十八条 一方以欺诈手段，使对方在违背真实意思的情况下实施的民事法律行为，受欺诈方有权请求人民法院或者仲裁机构予以撤销。