公司收购纠纷怎么处理

1、协商方式
自股东会会议决议通过之日起60日内，股东可以就股权收购问题与公司协商，如果双方就该问题达成协议则异议股东的股份收购请求权就已经行使完毕，在这种情况下是不需要通过诉讼行使该权利的。
2、诉讼方式
如果双方未能在60日内就股权收购达成协议的，异议股东可以自股东会会议决议通过之日起90日(即协商期满30日)内向人民法院提起诉讼，要求公司以合理价格收购其所持股权。
【法律依据】
根据《民事诉讼法》第3条规定：人民法院受理公民之间、法人之间、其他组织之间以及他们相互之间因财产关系和人身关系提起的民事诉讼，适用本法的规定。