原告代理人能不能提出判后答疑申请书

可以的。
有的高院申请再审，是一定要判后答疑的，否则立不了案。
下面是模板：
__区人民法院：
根据__人民法院___规定，现申请人___现就____一案，不认可贵院___判决结果，特提出如下答疑申请
第一关于___疑问。

第二关于___疑问。

第三关于___疑问。

第四关于___疑问。
综述：___
此致
__区人民法院
申请人：
年月日
《刑事诉讼法》第一百八十七条