在逃人員撤銷後會有案底嗎

不會有案底。案底指當事人過去犯法或犯罪行為的記錄，又稱犯罪人員犯罪記錄制度。所以，案件被撤銷，即説明在逃的犯罪嫌疑人沒有被依法定罪量刑。所以，該種情況下不會有案底。
《刑法》第三條 法律明文規定為犯罪行為的，依照法律定罪處刑；法律沒有明文規定為犯罪行為的，不得定罪處刑。