借名买房的协议书公证有效吗

无效。借名买房的协议是不可以公证的。房屋产权是以房产证上的登记为准的，由于私下签订的协议效力难以确定，即使做了公证，在法律上也是无效的，因为公证的前提必须建立在合法的基础上。
《中华人民共和国公证法》 第二条 公证是公证机构根据自然人、法人或者其他组织的申请，依照法定程序对民事法律行为、有法律意义的事实和文书的真实性、合法性予以证明的活动。