农村房屋超高怎么处理

没有高度限制，关键要符合城乡规划，取得乡村建设规划许可证。
《中华人民共和国城乡规划法》规定：
第四十一条在乡、村庄规划区内进行乡镇企业、乡村公共设施和公益事业建设的，
建设单位或者个人应当向乡、镇人民政府提出申请，由乡、镇人民政府报城市、县人民政府城乡规划主管部门核发乡村建设规划许可证。
在乡、村庄规划区内使用原有宅基地进行农村村民住宅建设的规划管理办法，由省、自治区、直辖市制定。