分公司能否作為行政處罰主體

不可以。
分公司是公司在其住所以外設立的從事經營活動的機構。分公司是不可以作為行政處罰物件的，處罰的應該是總公司，因為分公司不具有法人資格，其民事責任由公司承擔。
《公司法》第十四條