6年駕駛證到期被扣9分會影響換新駕駛證嗎

不會。
根據相關規定，機動車駕駛人在機動車駕駛證的六年有效期內，每個記分週期均未記滿12分的，換髮十年有效期的機動車駕駛證;在機動車駕駛證的十年有效期內，每個記分週期均未記滿12分的，換髮長期有效的機動車駕駛證。
《機動車駕駛證申領和使用規定》第五十六條機動車駕駛人在機動車駕駛證的六年有效期內，每個記分週期均未記滿12分的，換髮十年有效期的機動車駕駛證；在機動車駕駛證的十年有效期內，每個記分週期均未記滿12分的，換髮長期有效的機動車駕駛證。