警察会半夜两三点查房吗

理论上来说，是存在可以查房的可能性的。
因为检查旅馆实名登记旅客信息也是警察的工作之一。
只是没有特殊情况晚上基本是不查房检查登记率的，因为晚上查房就等于是警察在加班了。
检查登记率效果最好的时候是早上刚刚上班的时候（8-10点），这个时候旅馆里的旅客最多，更能突显出该旅馆的真实登记率。
法律依据：
《中华人民共和国治安管理处罚法》第二条
扰乱公共秩序，妨害公共安全，侵犯人身权利、财产权利，妨害社会管理，具有社会危害性，依照《中华人民共和国刑法》的规定构成犯罪的，依法追究刑事责任；尚不够刑事处罚的，由公安机关依照本法给予治安管理处罚。